Cây dứa [Ananascomosus (L.) Merr.] là loài cây trồng quan trọng có giá trịkinh tế nhất, sở hữu hệ thống quang hợp theo chu trình CAM (crassulacean acidmetabolism) mà chu trình này có đặc điểm tăng hiệu quả sử dụng nước cao hơn bởikiểm soát được sự đóng mở khí khổng cả ngày lẫn đêm.
Người ta muốn cung cấp luận điểm mới về cách điều tiết lá dứachết như thế nào (diel regulatory landscape in pineapple leaves). Các tác giảtiến hành phương pháp lập bản đồ “genome-wide mapping” tại điểm nhạy cảm củaDNase I (DHSs)của lá dứa vào ban ngày, lúc 2:00 pm và ban đêm lúc 10:00 pm, thông quaphương pháp giản đơn chạy DNase-seq.
Kết quả cho thấy, có 33340 đến 28753 điểm nhạy cảm DHSs được tìmthấy ở mô đầu lá xanh, và 29597 đến 40068 được xác định ở mô đáy lá màu trắngtại thời điểm 2 giờ và 10 giờ, theo thứ tự. Quan sát cho thấy đa số các gen củacây dứa chiếm ít hơn hai điểm nhạt cảm DHSs với độ dài phân tử ngắn hơn 1 kb,và promotor DHSs biểu hiện promoter xa (proximal) có xu hướng gắn với vị tríbắt đầu phiên mã TSS (transcription start site) (có >77% promotor DHSs cókích thước 1 kb). Hơn nữa, nhiều điểm nhạy cảm “intergenic DHSs” có tính đồng nhất xung quanh cácyếu tố phiên mã hoặc co-regulators phiên mã (TFs/TCs) nhiều hơn các gen có chức năng khác, điềuấy chỉ ra rằng có những bối cảnh điều tiết rất phức tạp diễn ra (complexregulatory contexts) xung quanh TFs/TCs. Kết quả phân tích mô có nhiều điểmnhạy cảm ưa thích (DHSs) và gen tương ứng, có 839 và 888 gen thay đổi thích hợptại đỉnh l1a xanh vào lúa 2 giờ và 10 giờ. (AcG2 và AcG10). Hơn nữa, AcG2-specific, AcG10-specific và DHSs tiếp cận phổ quát đượcphân tích từ các điểm nhạy cảm (DHSs) ưa thích trong quang hợp chu trình CAM.Các hệ thống điều tiết ấy cho thấy được những điều tiết mang tính chất cơ học(dynamic regulations) với các nguyên tố mang tính chất “multiple cis-regulatory elements”diễn ra đối với các gen biểu hiện có điều kiện (preferentially expressed genes)trong mô quang hợp. Đáng chú ý là, những binding motifs của nhiều phân tử TFs có tínhchất theo chu trình đều được xác định trong những DHSs nàycủa những gen chủ chốt (CAM genes), làm nên một điều tiết có tính chất đồng hồsinh học (circadian regulation) trong chu trình CAM kết hợp trong biểu hiện banđêm.
Kết quả này cung cấp cho chúng ta một bức tranh điều tiếtcủa chromatin tronglá dứa trong ban ngày và ban đêm. Kết quả sẽ cung cấp thông tin quan trọng hỗtrợ việc giả mã đồng hồ sinh học điều tiết ra làm sao trong chu trình quang hợpCAM