CNSH lĩnh vực khác
So sánh đặc điểm hệ gen ty thể của sán lá ruột nhỏ Haplorchis taichui với Metagonimus yokogawai và đơn vị mã hóa ribosome với H. pumilio (họ Heterophyidae)
(sokhcn.cantho.gov.vn - 22/10/2021):

Sán lá ruột nhỏ Haplorchis taichui và H. pumilio thuộc họHeterophyidae (Trematoda: Platyhelminthes), được nghiên cứu còn rất hạn chế,đặc biệt là chỉ thị phân tử hệ gen ty thể và đơn vị mã hóa ribosome.Nghiên cứu này nhằm mục tiêu cung cấpdữ liệu cho cá hướng nghiên cứu khác nhau sử dụng chuỗi gen/ chỉ thị phân tử cótừ hệ gen ty thể các loài trong họ Heterophyidae.

Nghiên cứu thu nhận toàn bộ hệ gen ty thể (mtDNA) của loàiH. taichui và toàn bộ phần mã hóa của đơn vị mã hóa ribosome (rTU hayrDNA) loài H. taichui và H. pumilio của Việt Nam. Dữ liệu nucleotide vàamino acid được so sánh giữa H. taichui và Metagonimus yokogawai về cácđặc điểm thành phần kiến tạo gen/hệ gen, đặc điểm sử dụng bộ mã hoặcnucleotide (độ lệch skew) và các cấu trúc lặp liền kề (TRU). Hệ gen tythể của chủng Htai-QT3-VN có độ dài 15.120 bp và M. yokogawai (15.258 bp,Hàn Quốc, KC330755) chứa 36 gen, gồm 12 gen mã hóa protein (cox1, cox2,cox3, nad1, nad2, nad3, nad4L, nad4, nad5, nad6, atp6 và cob), 2 gen RNAribosome (rRNA), 22 gen RNA vận chuyển (tRNA hay trn) và một vùng không mã hóa(NCR) giữa trnE và trnG, chia thành 2 tiểu vùng chứa 5 cấu trúc lặp(182-183 bp/cấutrúc). H. taichui (Việt Nam và Lào) sử dụng A = 19,56%, T= 39,71%, G = 28,34%, C = 12,39% (A+T là 59,27% và G+C là 40,73%) cho kiến tạomtDNA, có giá trị độ lệch (skew/skewness) ở A+T là âm (–0,340) và G+C làdương (0,392); cho 12 gen mã hóa protein (PCG) tương tự; nhưng cho genribosome ty thể (MRG, gồm 16S/rrnLvà 12S/rrnS) với A+T ít hơn (57,22%) vàvới G+C nhiều hơn (42,78%). M. yokogawai có tỷ lệ sử dụng A+T thấp hơn(mtDNA/55,68%, PCGs/55,96%, MRGs/54,15%) và G+C cao hơn so với loài H.taichui. H. taichui của Việt Nam và Lào có 10.164 bp mã hóa cho 3.376 aminoacid để kiến tạo 12 PCG với những bộ mã sử dụng nhiều nhất làPhenylalanine (Phe-TTT) và Leucine (Leu-TTG), những bộ mã ít nhất làGlutamine (Gln-CAA), Arginine (Arg-CGC), có thêm Thr-ACA/ACC ở M. yokogawai.Phần mã hóa đơn vị mã hóa ribosome (từ 5’ 18S đến 3’ 28S) của H. taichui(7.268 bp) và H. pumilio (7.416 bp) được xác định có 5 vùng gen gồm 18SrDNA, ITS1, 5.8S rDNA, ITS2 và 28S rDNA. Các gen 18S và 5.8S của cả 2 loàicó độ dài như nhau (1.992 bp/18S, 160 bp/5.8S), gen 28S khác nhau (3.875bp/H. taichui và 3.870 bp/H. pumilio). ITS1 ở H. taichui (797 bp) và ITS2 ởH. pumilio (280 bp) không chứa cấu trúc lặp, trong khi đó ITS1 ở H.pumilio (1.106 bp) chứa 5 cấu trúc lặp liền kề TRU gồm 136 bp cho 3 TRUvà 116 bp cho 2 TRU và ITS2 ở H. taichui (444 bp) chứa 3 TRU (83–85 bp/cấutrúc).

 

 
Tin tức khác
Tìm ra cách sinh tổng hợp các hợp chất trong thảo mộc
Tái khám phá cách các tế bào T ghi nhận protein gai của virus SARS-COV-2
Phương pháp thử nghiệm điều trị ung thư mới có thể “đánh thức” hệ miễn dịch
Đánh gía sơ bộ khả năng ức chế sự phát triển tế bào ung thư gan của viên nang chức cao lá mãng cầu xiêm (ANNONA MURICATA (L.), ANNONACEAE) 200MG trên mô hình in vitro và in vivo
Phát hiện đột biến gen RB1 trên mẫu mô u nguyên bào võng mạc tại miền Bắc Việt Nam năm 2020
Thông báo
Thông báo chuẩn bị hồ sơ đăng ký giao trực tiếp thực hiện từ năm 2019 thuộc Chương trình CNSH
Thông báo số 1: Hội nghị Công nghệ sinh học toàn quốc – Khu vực phía Nam lần thứ II năm 2011
Quyết định 490/QĐ-BNN-KHCN điều chỉnh cá nhân chủ trì đề tài thuộc “chương trình trọng điểm phát triển và ứng dụng công nghệ sinh học trong lĩnh vực nông nghiệp và ptnt đến năm 2020”.
THÔNG BÁO TUYỂN CHỌN TỔ CHỨC VÀ CÁ NHÂN CHỦ TRÌ NHIỆM VỤ KH&CN
Kết quả khảo nghiệm đánh giá an toàn sinh học đối với đa dạng sinh học và môi trường
Văn bản mới
Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn thông báo giao trực tiếp tổ chức, cá nhân thực hiện nhiệm vụ KHCN...
Quyết định 490/QĐ-BNN-KHCN điều chỉnh cá nhân chủ trì đề tài thuộc “chương trình trọng điểm phát triển...
Quyết định phê duyệt danh mục nhiệm vụ khoa học và công nghệ đưa vào tuyển chọn, giao trực tiếp bắt đầu...
Về việc cấp bằng bảo hộ giống cây trồng mới (kèm danh mục)
Bổ sung 71 chỉ tiêu tuyển sinh đào tạo thạc sĩ năm 2011 cho Trường Đại học Lâm nghiệp
Về việc giao dự toán NSNN năm 2011(Kinh phí bổ sung sự nghiệp khoa học Công nghệ năm 2011- nhiệm vụ cấp...
Giao dự toán ngân sách nhà nước năm 2011 (đợt 4) Kinh phí xử lý sự cố đê điều năm 2011 (Phụ lục kèm theo)
Tài Liệu mới
Rút ngằn thời gian vi nhân giống lan hồ điệp
Công nghệ sinh học trong nông nghiệp
Ảnh hưởng của các yếu tố sinh học lên sự nảy mầm
Kỹ thuật trồng hoa lan Mokara
Liên kết Website
Vụ khoa học công nghệ và môi trường bộ NN và PTNT
Viện công nghệ sinh học
Bộ nông nghiệp vf phát triển nông thôn
Agbiotech Việt Nam
Báo Nhân Dân
Trung tâm Khuyến nông Quốc gia
Thống kê truy cập
Số người đang online: 26
Tổng số lượt truy cập: 2322081
Ngân hàng Nông nghiệp và phát triển nông thôn
Copyright © 2011 Văn phòng Công nghệ sinh học - Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn
Địa chỉ : Số 02 Ngọc Hà, Ba Đình, Hà Nội. Điện thoại : (024) 38436817 - Fax: (024) 38433637
Email: webmaster@agrobitotech.gov.vn. Web site: www.agrobiotech.gov.vn