Tin quốc tế
Xác định những phân tử anchors trong chuỗi trình tự hệ gen lúa mạch
(link.springer.com/ - 07/09/2020):

Người ta xác định được 1,844 triệu anchors trongtrình tự đại genome của lúa mạch (pan-genome sequence) từ 12.306 giống lúa mạchthông qua phân tích bản đồ di truyền và  thuật toán machinelearning. Càng ngày người ta càng có chứng cứ rõ ràng hơn về các gen từmột  giống cây trồng cụ thể nào đó, sẽ rất xa với mục tiêu muốn bao phủtoàn bộ tất cả gen của loài cây trồng ấy. Do đó, xây dựng kiến thức về pan-genomes (đạigenome) vô cùng quan trọng trong di truyền và chọn giống. Thu thập hàng nghìnpan-genome của giống cây trồng, rồi sử dụng dữ liệu deep-sequencing làphương pháp tiếp cận tiến bộ hiện nay cho loài lúa mạch, mà bản thân hệ gen gennày có genome mang tính chất khổng lồ và độ lập lại cao. Người ta đã cố gắng xácđịnh các phân tử anchors của pan-genome sequencecây lúa mạch từ cơ sở dữ liệu khá hoành tráng GBS (genotype-by-sequencing);thông qua kết hợp phân tích bản đồ di truyền và công cụ thuật toán machinelearning. Trên cơ sở các chuỗi trỉnh tự GBS từ 11.166 giống lúa mạchthuần hóa và 1.140 mẫu giống lúa mạch hoang dại, người ta đã xác định được1,844 triệu phân tử anchors của pan-genomesequence. Trong đó, 532.253 anchors được xác định những tags mang tínhchất có/không có biến dị (PAV:presence/absence variation). Thông qua so sánh trình tự, những PAVtags này đối với genome của lúa mạch không có mày hạt (hullessbarley), giống Zangqing320, kết quả phân tích minh chứngđược 83,6% PAV từ các giống được thuần hóa, và 88,6% từ lúa mạch hoang dại.Phân tích di truyền association thời gian trổ, chiều cao cây và kích cỡ hạt lúamạch cho thấy có quan hệ lẫn nhau khá quan trọng của PAV và non-PAVtags tùy theo tính trạng nông học khác nhau. Hung anchors củapan-genome sequence trên cơ sở phân tích GBStags có thể tạo điều kiện thuận lợi để người ta xây dựng nênmột pan-genome tiêu chuẩn và giúp cho việc nghiên cứu di truyền phong phú hơn,đặc biệt là xác định cấu trúc biến dị di truyền, làm bản đồ di truyền và cảitiến giống lúa mạch hiệu quả.

 

 
Tin tức khác
Vi khuẩn E.coli tạo cơ hội dẫn đường để cải thiện quá trình quang hợp
Bướm đêm Diamondback sử dụng các chất phòng vệ thực vật làm tín hiệu đẻ trứng
Ảnh hưởng của thời gian gây úng đến sinh trưởng, sinh lý và năng suất của đậu xanh trong điều kiện nhà lưới
Sử dụng chỉ thị phân tử xác định các giống/dòng lúa đặc sản có hàm lượng amylose thấp và protein cao
CUBIC: một atlas trong cải tiến giống bắp
Thông báo
Thông báo chuẩn bị hồ sơ đăng ký giao trực tiếp thực hiện từ năm 2019 thuộc Chương trình CNSH
Thông báo số 1: Hội nghị Công nghệ sinh học toàn quốc – Khu vực phía Nam lần thứ II năm 2011
Quyết định 490/QĐ-BNN-KHCN điều chỉnh cá nhân chủ trì đề tài thuộc “chương trình trọng điểm phát triển và ứng dụng công nghệ sinh học trong lĩnh vực nông nghiệp và ptnt đến năm 2020”.
THÔNG BÁO TUYỂN CHỌN TỔ CHỨC VÀ CÁ NHÂN CHỦ TRÌ NHIỆM VỤ KH&CN
Kết quả khảo nghiệm đánh giá an toàn sinh học đối với đa dạng sinh học và môi trường
Văn bản mới
Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn thông báo giao trực tiếp tổ chức, cá nhân thực hiện nhiệm vụ KHCN...
Quyết định 490/QĐ-BNN-KHCN điều chỉnh cá nhân chủ trì đề tài thuộc “chương trình trọng điểm phát triển...
Quyết định phê duyệt danh mục nhiệm vụ khoa học và công nghệ đưa vào tuyển chọn, giao trực tiếp bắt đầu...
Về việc cấp bằng bảo hộ giống cây trồng mới (kèm danh mục)
Bổ sung 71 chỉ tiêu tuyển sinh đào tạo thạc sĩ năm 2011 cho Trường Đại học Lâm nghiệp
Về việc giao dự toán NSNN năm 2011(Kinh phí bổ sung sự nghiệp khoa học Công nghệ năm 2011- nhiệm vụ cấp...
Giao dự toán ngân sách nhà nước năm 2011 (đợt 4) Kinh phí xử lý sự cố đê điều năm 2011 (Phụ lục kèm theo)
Tài Liệu mới
Rút ngằn thời gian vi nhân giống lan hồ điệp
Công nghệ sinh học trong nông nghiệp
Ảnh hưởng của các yếu tố sinh học lên sự nảy mầm
Kỹ thuật trồng hoa lan Mokara
Liên kết Website
Vụ khoa học công nghệ và môi trường bộ NN và PTNT
Viện công nghệ sinh học
Bộ nông nghiệp vf phát triển nông thôn
Agbiotech Việt Nam
Báo Nhân Dân
Trung tâm Khuyến nông Quốc gia
Thống kê truy cập
Số người đang online: 33
Tổng số lượt truy cập: 1962401
Ngân hàng Nông nghiệp và phát triển nông thôn
Copyright © 2011 Văn phòng Công nghệ sinh học - Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn
Địa chỉ : Số 02 Ngọc Hà, Ba Đình, Hà Nội. Điện thoại : (024) 38436817 - Fax: (024) 38433637
Email: webmaster@agrobitotech.gov.vn. Web site: www.agrobiotech.gov.vn