(journals.plos.org - 02/08/2019):
Lúa dị tứ bội (autotetraploid) là nguồn vật liệu di truyềnhữu ích cho chọn tạo giống lúa tứ bội thể, tuy nhiên, số hạt trên bông ít làrào cản chính khi thương mại hóa giống lúa tứ bội. Nhóm các nhà khoa học nghiêncứu nội dung này đã tiến hành phát triển các dòng lúa tứ bội thế hệ mới đượcgọi là “neo-tetraploid rice lines”. Chúng có tính trạng hữu thụ caovà cho ưu thế lai rõ ràng khi lai chúng với một dòng lúa tứ bội khác. Theo đó,người ta đã tiến hàng giải trình tự lần nữa (re-sequencing) và chạy “RNA-seq”để tìm kiếm những biến thể của DNA và các phân tử gen DEGs (differentiallyexpressed genes) trong thời kỳ gián phân giảm nhiễm đối với 3 dòng lúa“neo-tetraploid” so sánh với bố mẹ của chúng. Có tất cả 4.109.881 SNPs và640.592 chỉ thị InDels trong tìm kiếm các dòng lúa “neo-tetraploid” đối vớigenome tham chiếu, và 1.805 biến thể đặc biệt có/không có (PAVs:present/abscent variations) trong 3 dòng lúa này. Ước khoảng 12% chỉ thị SNPsvà 0,5% chỉ thị InDels được xác định trong 3 dòng này định vị trên vùng ditruyền mong muốn tìm. Có tất cả 28 gen, mang ít nhất một ảnh hưởng SNP hoặc/vàInDel nào đó làm nên sự mã hóa protein, mà những gen ấy đã được xác định trong3 dòng lúa này. Theo đó, 324 gen đột biến đặc biệt, bao gồm 52 gen liên quanđến gián phân giảm nhiễm và 8 gen thuộc di truyền biểu sinh đã được tìm thấytrong các dòng lúa “neo-tetraploid” so vối bố mẹ của chúng. Trong 324 gennhư vậy, 5 gen liên quan đến gián phân, 3 gen liên qua n đến di truyền biểusinh thể hiện trong giai đoạn gián phân giảm nhiễm. Tương tự, có 498 phân tửtranscripts đặc biệt, 48 transposons khác nhau và 245 phân tử ncRNAs khác nhaucũng được tìm thấy trong cây lúa “neo-tetraploid”. Xem: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6450637/
|