Tin quốc tế
Phân tích Đa dạng di truyền cây lúa bằng chỉ thị SNP
(ncbi.nlm.nih.gov - 09/07/2018):

Người ta áp dụng phương pháp GBS (genotyping-by-sequencing) trêncơ sở chỉ thị phân tử SNP và quần thể hồi giao lúa của 11 cặp lai (thể thế hệBC1F5), bao gồm mộttập đoàn giống có 564 dòng khác biệt nhau và 12 dòng bố mẹ. Giải trình tự bằng“10 Ion Proton runs” cho ra kế quả 943,4 triệu lượt đọc nháp, trong đó, có 881,6 triệu lần đọc được duy trì sau khi “trimming”đối với những bases có chất lượng kém. Sau khi so sánh với trình tự tham chiếutrong cơ sở dữ liệu (alignment), có tất cả 794.297 chỉ thị SNPs biểu hiện đahình, sau khi  “filtering”, người ta có được kết quả LMD50 SNPs (lowmissing data, with each SNP, genotyped in at least 50% of the samples) đối vớitừng quần thể phụ. Mỗi một “data point”, người ta có được sự trợ giúp của cơ sởdữ liệu trình tự hiện hữu mà không có bất cứ một lỗi nào, hoặc rất ít lỗi trongnội dung “SNP calling”. Kết quả “genotyping” có tác động đến nội dung cải tiếngiống lúa, bởi vì: (a) gen mục tiêu được du nhập từ giống cho vào trong quầnthể  ILs đều được định tính rõ ràng với tần suất thành công được ghi nhậntại nhiều vùng trong genome, chủ yếu do chọn lọc chặt chẽ du7o71i stress phisinh học, (b) dị hợp tử tương đối rõ trong quần thể ILs. Việc chú thích mangtính chất giải nghĩa trong trình tự (functional annotation) cho thấy có 426SNPs mang tính chất “non-synonymous deleterious” tại 102 loci trung bình có 1–4SNPs / locus và có 120 chỉ thị SNPs mới. Kết quả “SNP-typing” cung cấp chochúng ta một panel về tính đa dạng di truyền, kết quả ấy sẽ hỗ trợ tích cực chonội dung cải tiến giống lúa nhờ chỉ thị phân tử một cách vô cùng hiệu quả.

 

 
Tin tức khác
Gen giúp cây lúa chống chịu với manganese
Nghiên cứu giải thích vai trò của auxin trong phát triển rễ lúa
Nông nghiệp Đan Mạch và những thành tích đáng nể
Ứng dụng công nghệ IoT vào nông nghiệp Nhật Bản
Loài tê giác trắng phương Bắc có thể thoát nguy cơ tuyệt chủng
Thông báo
Thông báo số 1: Hội nghị Công nghệ sinh học toàn quốc – Khu vực phía Nam lần thứ II năm 2011
Quyết định 490/QĐ-BNN-KHCN điều chỉnh cá nhân chủ trì đề tài thuộc “chương trình trọng điểm phát triển và ứng dụng công nghệ sinh học trong lĩnh vực nông nghiệp và ptnt đến năm 2020”.
THÔNG BÁO TUYỂN CHỌN TỔ CHỨC VÀ CÁ NHÂN CHỦ TRÌ NHIỆM VỤ KH&CN
Kết quả khảo nghiệm đánh giá an toàn sinh học đối với đa dạng sinh học và môi trường
Biểu mẫu về dự toán kinh phí áp dụng cho các đề tài nghiên cứu KHCN do Bộ quản lý thực hiện từ năm 2011
Văn bản mới
Quyết định 490/QĐ-BNN-KHCN điều chỉnh cá nhân chủ trì đề tài thuộc “chương trình trọng điểm phát triển...
Quyết định phê duyệt danh mục nhiệm vụ khoa học và công nghệ đưa vào tuyển chọn, giao trực tiếp bắt đầu...
Về việc cấp bằng bảo hộ giống cây trồng mới (kèm danh mục)
Bổ sung 71 chỉ tiêu tuyển sinh đào tạo thạc sĩ năm 2011 cho Trường Đại học Lâm nghiệp
Về việc giao dự toán NSNN năm 2011(Kinh phí bổ sung sự nghiệp khoa học Công nghệ năm 2011- nhiệm vụ cấp...
Giao dự toán ngân sách nhà nước năm 2011 (đợt 4) Kinh phí xử lý sự cố đê điều năm 2011 (Phụ lục kèm theo)
Tài Liệu mới
Rút ngằn thời gian vi nhân giống lan hồ điệp
Công nghệ sinh học trong nông nghiệp
Ảnh hưởng của các yếu tố sinh học lên sự nảy mầm
Kỹ thuật trồng hoa lan Mokara
Liên kết Website
Vụ khoa học công nghệ và môi trường bộ NN và PTNT
Viện công nghệ sinh học
Bộ nông nghiệp vf phát triển nông thôn
Agbiotech Việt Nam
Báo Nhân Dân
Trung tâm Khuyến nông Quốc gia
Thống kê truy cập
Số người đang online: 112
Tổng số lượt truy cập: 569368
Ngân hàng Nông nghiệp và phát triển nông thôn
Copyright © 2011 Văn phòng Công nghệ sinh học - Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn
Địa chỉ : Số 02 Ngọc Hà, Ba Đình, Hà Nội. Điện thoại : (024) 38436817 - Fax: (024) 38433637
Email: webmaster@agrobitotech.gov.vn. Web site: www.agrobiotech.gov.vn